По словам руководителя Vega Squadron Алексея Кондакова, пятёрка показала лучшие результаты на просмотре, но состав может измениться до закрытия трансферного окна перед The International 2017.
Илья «ALOHADANCE» Коробкин покинул Virtus.pro G2A 30 июня 2016 года и выступал за F.R.I.E.N.D.S. с Василием «AfterLife» Шишкиным. Айрат «Silent» Газиев перешёл в запас VP из-за проблем со здоровьем в марте 2016 года, не прошёл квалификации к The International 2016 c Polarity и прервал карьеру игрока.
О перестановках в составе Vega Squadron Кондаков объявил 25 марта. Через шесть дней организация сообщила, что место в составе гарантировано только Семёну «CeMaTheSlayeR» Кривуле. Остальных игроков выбрали по итогам просмотров. 6 апреля Артем «Fng» Баршак опубликовал в «твиттере» первые буквы никнеймов игроков нового состава Vega.
В сезоне 2016/2017 Vega Squadron не отобралась на The Boston Major 2016, Dota 2 Asia Championships 2017 и The Kiev Major 2017. После неудач команда расставалась с Fng, Ростиславом «fn» Лозовым, Богданом «Iceberg» Василенко, Дмитрием «Ditya Ra» Миненковым, Андреем «Mag» Чипенко и Акбаром «SoNNeikO» Бутаевым.